四.电泳实验
1. 在琼脂糖电泳中,DNA电泳Marker分离不明显怎么办?
(1)琼脂糖浓度以及质量:Marker跑不开一般是指的大片段,目前常用1%琼脂糖凝胶,具体使用需要根据自己片段大小选择,一般大片段用低浓度胶,小片段选择高浓度胶;
凝胶 浓度 | 0.5% | 0.7% | 1% | 1.2% | 1.5% | 2% |
DNA长度 | 1000bp ~30kb | 800bp ~12kb | 500bp ~10kb | 400bp ~7kb | 200bp ~3kb | 50bp ~2kb |
(2)电泳时间:指示剂达4/5处较好,大片段可适量延长时间;
(3)电泳电压:低浓度胶电压应选择适当降低,普通电泳应该在80V~100V之间。
2. 琼脂糖凝胶电泳的TAE缓冲液和TBE缓冲液的利弊?
缓冲液作用是维持合适的pH。正负极都会发生氧化还原反应,长时间的电泳将使正极变酸,负极呈碱性。缓冲系统溶液使两极的pH保持基本不变。TAE缓冲液对大于13kb 的片段分离效果好,可用于回收 DNA 片段。但不适用于长时间电泳。而TBE缓冲液的缓冲能力较TAE缓冲液强,适合长时间电泳。但TBE缓冲液含有硼酸成分影响DNA回收效率以及后续的酶反应。